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Tipo de Mídia:
Texto
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Formato:
.pdf
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Tamanho:
7,29
MB
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Título: |
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Bases estruturais e termodinâmicas do reconhecimento molecular em DNA, peptídeos e proteínas: modelos de papilomavirus e proteína tirosina fosfatase |
Autor: |
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Joana Faber Barata
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Categoria: |
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Teses e Dissertações |
Idioma: |
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Português |
Instituição:/Parceiro |
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[cp] Programas de Pós-graduação da CAPES
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Instituição:/Programa |
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UFRJ/QUÍMICA BIOLÓGICA |
Área Conhecimento |
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BIOQUÍMICA |
Nível |
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Doutorado
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Ano da Tese |
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2207 |
Acessos: |
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339 |
Resumo |
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A proteína E2 de papilomavírus é a principal proteína regulatória desse vírus e se liga a uma
seqüência consenso ACCg-N4-cGGT no genoma viral. Nesta tese foi testada a habilidade de
um peptídeo com 18 aminoácidos correspondente à hélice de reconhecimento ao DNA desse
vírus (α-hélice-1) de reconhecer e ligar seqüências de DNA contendo a seqüência consenso.
Medidas estequiométricas quantitativas mostram o reconhecimento específico do sítio ACCG
do DNA sem a necessidade da proteína inteira. Apesar da capacidade de reconhecimento e
ligação ao DNA ser mantida, foi verificado por medidas de dicroísmo circular que o peptídeo
encontra-se desenovelado em solução. Este fato é confirmado por simulações de dinâmica
molecular que mostram que o peptídeo é parcialmente desenovelado em solução, e que esse
desenovelamento é parcialmente reduzido após a formação do complexo com DNA, sugerindo
que os contatos entre o peptídeo e o DNA são os principais responsáveis pela manutenção da
conformação helicoidal. Esses dados demonstram que a ligação específica não é dependente
da conformação da hélice e que uma seqüência de aminoácidos mínima é suficiente para que
ocorra o reconhecimento e ligação ao DNA. Ensaios cristalográficos do complexo foram feitos
numa tentativa de buscar um maior entendimento dessa ligação. Além disso, nessa tese
também foram resolvidas a estrutura de duas proteínas tirosino fosfatases (PTP). A estrutura
da PTPσ foi resolvida na presença de um inibidor da enzima. A estrutura inédita da PTP-IA2,
uma importante PTP envolvida com diabetes tipo 1, também foi resolvida nessa tese. Juntas,
essas duas estruturas contribuem para um aumento no entendimento do funcionamento dessa
enzima que pode ser utilizado em trabalhos posteriores para o desenvolvimento de fármacos
seletivos para esses alvos biológicos.
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