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Tipo de Mídia:
Texto
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Formato:
.pdf
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Tamanho:
1,08
MB
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Título: |
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Mapeamento de QTLs em populações com pedigrees complexos |
Autor: |
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Maria Imaculada de Sousa Silva
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Categoria: |
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Teses e Dissertações |
Idioma: |
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Português |
Instituição:/Parceiro |
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[cp] Programas de Pós-graduação da CAPES
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Instituição:/Programa |
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UFLA/ESTATÍSTICA E EXPERIMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA |
Área Conhecimento |
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AGRONOMIA |
Nível |
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Doutorado
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Ano da Tese |
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2008 |
Acessos: |
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166 |
Resumo |
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Muitos tipos de marcadores moleculares podem ser usados atualmente; em especial para detectar locos controladores de caracteres quantitativos (QTLs). O objetivo usual é identificar posições e efeitos em modelos com número determinado de QTLs. A maior parte dos delineamentos utilizados considera populações originadas de cruzamentos simples (e suas gerações F2 e ou de retrocruzamento). Nestes casos; modelos bialélicos e análise de efeitos fixos para alelos dos QTLs são empregados. Este trabalho teve por objetivo implementar uma análise bayesiana para o mapeamento conjunto de número e efeitos de QTLs mulialélicos; em um contexto de modelos mistos. Um pedigree complexo de duas gerações foi simulado com os respectivos valores genéticos e fenotípicos. Todo o pedigree; fenótipos das marcas e do caráter em estudo foram considerados conhecidos. Um procedimento Monte Carlo via Cadeias de Markov foi implementado para gerar amostras da distribuição a posteriori conjunta; usando o amostrador de Gibbs; quando possível; e o algoritmo Metropolis-Hastings; quando necessário. O método de saltos reversíveis (RJ) foi implementado para permitir que modelos com diferentes números de QTLs fossem amostrados. Os parâmetros desconhecidos nos modelos são a média geral e a variância residual; posições de QTLs; efeitos aditivos de alelos e dominantes de interações alélicas intra-locus; bem como suas respectivas variâncias aditiva e de dominância por loco. Tais parâmetros foram condicionados ao número de QTLs em cada modelo; implicando em modelos com diferentes dimensões. Foram realizadas três simulações. As amostras RJ da primeira; com cinco fundadores e seis filhos por cruzamento; permitiram inferência sobre o número de QTLs; mas a inferência sobre posição e efeitos seria imprecisa. A análise do modelo condicionado no número correto de QTLs (três) não melhorou a inferência sobre a posição e efeitos; em relação ao RJ. Tanto o aumento do número de filhos por cruzamento quanto a maior saturação do mapa resultaram em distribuições a posteriori que permitiram inferência mais precisa; mas os resultados não foram conclusivos. A metodologia mostrou-se promissora in totum; mas é preciso desenvolver programas mais rápidos e eficientes para permitir a análise de pedigrees mais extensos. |
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